La Compagnie des Bateaux-Mouches varò la sua prima imbarcazione con tetto in vetro nel 1949, ma la navigazione organizzata sulla Senna risale all'Esposizione Universale del 1867, quando traghetti a vapore trasportavano i visitatori tra i padiglioni.
La flotta odierna parte dal Port de la Bourdonnais, una banchina in pietra sotto il Pont d'Iéna dove la struttura in ferro di 330 metri di Gustave Eiffel si erge direttamente sopra. Il porto fu ufficializzato nel 1889 per servire le prime folle della torre, e la sua posizione rimane invariata.
I biglietti per la crociera sulla Senna e la Torre Eiffel garantiscono l'accesso a circuiti turistici di un'ora che passano sotto trentasette ponti, tra cui il Pont Alexandre III con le sue Fama dorate e il Pont Neuf, il ponte più antico di Parigi, completato nel 1607. Le barche scivolano lungo il fianco meridionale dell'Île de la Cité, offrendo scorci sui contrafforti di Notre-Dame e le torri medievali della Conciergerie. Il commento registrato multilingue identifica ogni monumento per nome e data di costruzione. Le imbarcazioni standard trasportano 350 passeggeri su due ponti; il livello superiore aperto permette viste senza ostacoli sulla facciata Beaux-Arts del Musée d'Orsay e sulla volta a botte in vetro del Grand Palais.
I biglietti combinati abbinano la crociera all'accesso programmato in ascensore alla seconda piattaforma della Torre Eiffel a 115 metri, o a degustazioni opzionali di crêpes presso i padiglioni lungo il fiume gestiti dai Bateaux Parisiens. Le partenze serali tra le 20:00 e le 22:00 coincidono con la sequenza luminosa oraria della torre, uno spettacolo di cinque minuti con 20.000 lampadine installate nel 1985. Il percorso del tour della crociera sulla Senna si estende per 9,8 chilometri dal Pont de Bir-Hakeim al Pont de Sully, circumnavigando sia l'Île de la Cité che l'Île Saint-Louis. Le navigazioni invernali offrono cabine riscaldate; i mesi estivi aggiungono posti a sedere all'aperto sui ponti solarium anteriori.
Il terminal del Port de la Bourdonnais si trova a 180 metri a sud-est del pilastro sud della torre, accessibile tramite il sentiero di Quai Branly. I giardini del Trocadéro e il Campo di Marte incorniciano il punto di imbarco, e il giardino verticale del Musée du Quai Branly si eleva a 200 metri verso est. I biglietti per la crociera sulla Senna con imbarco alla Torre Eiffel prenotano slot di partenza per gestire la capacità del molo durante le stagioni di punta di luglio e agosto, quando il conteggio giornaliero dei passeggeri supera le 4.200 unità. Le audioguide sono disponibili in quattordici lingue e le passerelle accessibili in sedia a rotelle servono le zone di seduta del ponte inferiore.
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